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ARTICULOS GENERALES
Clasificación y determinación del número óptimo de conglomerados en bancos de germoplasma
Classification and determination of the optimal cluster number in Plant Germplasm Banks
Osmany Molina Concepción1, Raisa García Rodríguez1, Marilys Milián Jimenez1, Lianet González Díaz1, Carmen C. Pons Pérez1 y Ricardo Grau Abalo2
1-Instituto de Investigaciones de Viandas Tropicales (INIVIT). Apdo #6. Santo Domingo, Villa Clara, Cuba.
2-Universidad Central "Marta Abreu" de Las Villas. Carretera a Camajuaní km 6½. Santa Clara, Villa Clara,Cuba.
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RESUMEN
El presente trabajo está encaminado a determinar el método de combinación de agrupamiento que mejor responda a la clasificación no supervisada de los bancos de germoplasma en estudio y el índice de validación que mejor determine el número óptimo de conglomerados jerárquicos aglomerativos. En la investigación se utilizó la métrica de Gower para variables mixtas y se combinó las soluciones provenientes de los diferentes métodos de agrupamiento para obtener una topología consenso. La fortaleza de los agrupamientos obtenidos del conjunto de datos por los métodos de aglomeración fue evaluada con el coeficiente aglomerativo y los conglomerados consenso, con el índice RV. El número de conglomerado óptimo se determinó utilizando cinco índices de validación que no brindaron un resultado homogéneo. La mejor estructura consenso para las bases de datos en estudio se obtuvo con el método Manhattan. Se utilizaron funciones implementadas en el lenguaje de programación R. Esta estrategia de análisis fue aplicada por primera vez para la clasificación taxonómica de las colecciones cubanas de germoplasma de malanga (Xanthosoma spp.) y plátanos (Musa spp.).
